摩斯漢堡食品安全政策秉持著「安心安全有信心，健康美味很用心，客人滿意又放心」的理念，除了用心堅持的美味，也有專業的實驗室團隊協助檢驗確保產品品質，摩斯漢堡食品檢驗中心於2010年成立，為連鎖速食業首位取得全國認證基金會(TAF)及衛生福利部食品藥物管理署(TFDA)雙認證實驗室，在嚴謹的認證過程及監督管理機制下，有效監控實驗室品質系統與技術操作達到國際水平，未來也將持續維持一貫的好品質，並積極開發建立檢驗技術。
除了既有認證項目外，在檢驗方法方面，為滿足顧客期許，食品檢驗中心也於2023年導入包裝飲用水及盛裝飲用水中綠膿桿菌，提升實驗室檢驗能量同時，也提供更多樣化的檢驗服務。
<微生物檢驗>
● 通過TFDA認證檢驗方法【食品】生菌數、大腸桿菌群、大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、腸桿菌科
● 通過TAF認證檢驗方法
【食品】生菌數、大腸桿菌群、大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、沙門氏菌、單核球增多性李斯特菌、腸桿菌科
【飲用水】水中總菌落數、水中大腸桿菌群
● 參照TFDA公告檢驗方法
【食品】仙人掌桿菌、金黃色葡萄球菌腸毒素、單核球增多性李斯特菌、綠膿桿菌(2023年新增)
● 參照國際分析化學家學會(AOAC)認可之檢驗方法
【食品】生菌數、大腸桿菌群、大腸桿菌、大腸桿菌O157：H7
● 其他檢驗方法
【食品】仙人掌桿菌、腸炎弧菌、單核球增多性李斯特菌
【環境塗抹】生菌數、大腸桿菌群
<化學性檢驗>
● 農藥殘毒快速檢測方法● 動物用藥快速檢測方法
